São considerados homólogos (homo = igual) entre si os cromossomos que juntos formam um par. Esses pares só existem nas células somáticas, que são diplóides (2n).
Num par, os dois homólogos possuem genes para os mesmos caracteres. Esses genes têm localização idêntica nos dois cromossomos (genes alelos). Na célula-ovo ou zigoto, um cromossomo é herdado do pai e outro da mãe e ficam emparelhados.
Na maioria dos organismos multicelulares, cada célula do corpo do indivíduo possui dois conjuntos de cromossomos equivalentes, isto é,em cada célula, os cromossomos são iguais dois a dois, no que se refere ao tamanho e a forma. OS dois representantes de cada par cromossômico são chamados de cromossomos homólogos (do grego homoios, igual, semelhante)