No Linux, você pode mudar a seu gosto, resolver seus problemas, mudar o código fonte, pintar e bordar com o Linux.
A segurança do sistema está nas mãos do administrador.
No caso do windows, você fica dependendo de uma atualização que as vezes demora meses, quando vem, e depende de outros softwares pagos Firewall, Anti virus, etc ( caso seja pra uso comercial ).
Até que pra uso doméstico, tem os freewares que quebram um galho, mesmo assim causam dependencia de updates.
Linux trava! Bém menos que o windows, mas tava ( comigo ainda não aconteceu ), ou seja, é mais "ESTÁVEL".
A segurança está na mão de quem usa, e pra que usa.
Virus pra Linux existe sim, mas diferente do windows, sua ação é limitada.
Ja existe um pra ambos, lí outro dia em um forum, mas de novo, no caso do Linux ele fica restrito a uma pasta.